E1 mito del diluvio sobreviene en tres versiones cuyos rasgos básicos demuestran que proceden de un prototipo común. La humanidad ofende gravemente a los dioses y es castigada a instancias de Enlil con un diluvio destinado a extinguirla; pero se salvan un hombre y su familia gracias a la intervención del dios Enki o Ea. El mito sumerio se conserva fragmentariamente, pero constituye la fuente de las versiones mesopotámicas posteriores y describe la institución de la civilización, la monarquía, las ciudades-estado y la irrigación en Sumeria.
Tras una laguna en el texto, aparece Enki hablando sobre la decisión de los dioses de destruir a la humanidad con un diluvio, a pesar de las protestas de Inanna, la diosa madre. Enki desea salvar al virtuoso rey Ziusudra y le cuenta las intenciones de los dioses hablándole a través de la pared de cañas de su casa. En este punto vuelve a interrumpirse el texto, pero probablemente Ziusudra recibiría instrucciones para construir un barco, porque continúa con una descripción de un diluvio de siete días, en los quelos vientos azotaron el enorme barco sobre las grandes aguas. Después aparece Utu, el dios del sol, en su barca, y devuelve la luz. Ziusudra sale para ofrecer un sacrificio a An y Enlil, que parecen los causantes del diluvio. Aplacados, repueblan la tierra, renuevan la vegetación y por último conceden a Ziusudra la vida eterna, como un dios.
La tercera versión del mito se encuentra en la undécima tablilla de la epopeya de Gilgamesh, en la que el héroe Utnapishtim cuenta cómo sobrevivieron su familia y él.